A Zsinat Elnöksége képviseli a Magyarországi Református Egyházat a külföldi és hazai egyházaknál, eljár az állam illetékes szerveinél, valamint tartja a kapcsolatot az ökumenikus szervezetekkel, de egyebek mellett összehívja és levezeti a zsinati tanácskozásokat is.
A XV. zsinati ciklus alakuló ülésén, 2021. február 17-én, szerdán délelőtt Balog Zoltán dunamelléki püspököt választották a Zsinat lelkészi elnökévé, Molnár János tiszántúli főgondnokot pedig a Zsinat presbiteri elnökévé. A Zsinat lelkészi alelnöke Pásztor Dániel tiszáninneni püspök lett, a Zsinat presbiteri alelnöke dr. Nemes Pál dunántúli főgondnok lett.
Steinbach József
a Zsinat lelkészi elnöke
Dunántúli Református Egyházkerület– püspök
Molnár János
a Zsinat világi elnöke
Tiszántúli Református Egyházkerület– főgondnok
Pásztor Dániel
a Zsinat lelkészi alelnöke
Tiszáninneni Református Egyházkerület– püspök
Nemes Pál, dr.
a Zsinat világi alelnöke
Dunántúli Református Egyházkerület– főgondnok